Примирието между групите трае почти една година, докато не се намери вирус в един от бандитните компютри. Сега трябва да започнем ожесточена битка в Metal Slug 4, за да не позволим на кибернетичната атака да се разпространи в главния сървър. Заплахата от унищожение е силна, която може да поеме не само компютърната система на крадците в закона, но да стане опасна за корпорацията"Антеус", която наблюдава интернет мрежите на страната. Тревър Спейси и Касел Надя вече са в пълна ръка и са готови да се втурнат заедно с вас на натрапници. Не оставяйте екипа си да изчака, незабавно да напусне зоната за комфорт и да започне борба с противниците.