Светът на жителите на желето е голям и разнообразен и сред тях има клан воини-нинджи. Те се различават от обикновените желета с черна превръзка, докато самите те могат да бъдат от всякакъв цвят. Този клан ви предизвиква и в играта Jelly Ninja. Просто трябва да изберете режима на игра: за известно време или срещу грешки. Времето в режим предполага, че играете една минута, но може да продължи, ако хванете летящ будилник. В режим без грешки ще играете, докато скалата вдясно стане напълно червена и това ще се случи, ако пропуснете определен брой желета, преди да ги отрежете. Има много желе нинджи, които не могат да бъдат победени с натискане на сабята.