Известният водопроводчик Марио редовно поддържа реда в Кралството на гъбите, периодично спасява принцесата и се бие с Боузър и неговите слуги. Но дори такъв неуморен герой понякога се нуждае от почивка. През определен век смел човечец с червена шапка реши да си вземе почивка и отиде в тропиците. Той отдавна мечтае да посети джунглата, където ще го срещнете в Super Mario Run 3D. В началото всичко беше наред. Взе лодка и реши да слезе по река Амазонка. Но лодката започна да тече, той трябваше да се приземи на брега и да тръгне пеша през гората. Марио изобщо не се страхува от дивите гори, той отдавна мечтае да живее сам сред природата, от суматохата и проблемите. Нощем той запалил огън, а на сутринта продължил пътя си към следващото село. Скоро той видя заселването на малко племе и щеше да остане малко при тях, ако те се съгласят да го приемат. Но местните се оказаха канибали и вместо гостоприемство му предложиха котел с вряща вода, на което нашият герой, естествено, не се съгласи. Той, колебайки се, се втурна да бяга, диваците се втурнаха след него. Помогнете на Марио да не се превръща в бульон в Super Mario Run 3D.