Героят на играта Final Ninja смята себе си за последния нинджа от своя вид. Враждебният клан успя да унищожи всички роднини на героя, но той няма да се откаже. Дори и да трябва да умре, той възнамерява да вземе всичките си врагове със себе си. Междувременно трябва да намерите леговището на враговете и за да направите това, ще трябва да преодолеете много препятствия. Използвайте стрелките, за да се движите и като щракнете върху бутона на мишката, изхвърлете шурикените. Ако задържите клавиша, докато хвърляте, можете да се хванете и да се издърпате до по-високи платформи, до които не можете да скочите във Final Ninja.