Сред нинджите, както и сред обикновените хора, лошите и героят от играта Ninja Fighter идват заедно с тях и трябва да се бият. Той не е сам, има доброволни асистенти и те ще дойдат. Но основната надежда за героя, който ще управлявате. Той е по-силен, по-хитър и всички останали ще го последват. Потърсете враговете и ги унищожете. Те са силни и имат същите тайни като най-напредналите нинджи. Но тяхната слабост е, че те са зли и безпринципни и добри винаги преодоляват злото. Управлявайте стрелките, изчертани в долната част на екрана, ако играете на устройство с тъч скрийн. Ако има клавиатура, използвайте ASDW клавишите.
