Във втората част на играта Virus Ninja 2 ще помогнете на смел войн нинджа да се бори с различни вируси. Пред вас на екрана ще има игрално поле, на което ще се появят различни бактерии. Те ще се движат в различни посоки и с различна скорост. За да ги унищожите ще трябва да използвате меч. Внимателно погледнете екрана и управлявайте обекти с мишката. По този начин ще ударите бактериите и ще ги нарежете на парчета. Понякога сред тези обекти могат да се появят бомби. Не трябва да ги люлеете.
