Героят на играта Super Portal Maze 3D се озова в триизмерен пъзел лабиринт. Той не е съвсем обикновен. Вместо традиционните коридори, които водят в различни посоки, разклоняват се и се опитват да объркат всички, ще видите само една стая и няколко кръгли изхода с различни цветове. В стаята има довършително знаме, към което трябва да предадете героя и различни опасни препятствия. Задачата е да стигнете до флага с помощта на специални портали. Те обикновено са сдвоени. Тоест, влизайки в единия, излизате от другия. Помислете и изберете двойката, която ще ви доведе до завършване на нивото в Super Portal Maze 3D.