Всеки път, когато някакъв вирус или друго нежелано вещество се опита да влезе в тялото ви и да установи там свои собствени правила, имунната система започва да се бори. В играта Immune system Command ще видите това от първа ръка и дори ще можете да помогнете на системата да отблъсква атаки отвън. Този път тялото е подложено на яростна атака от различни вируси. Те се появяват отдясно, отляво, летят отгоре. Трябва да щракнете върху елементите по-долу, за да отделят антитела срещу вируси и бактерии, които ще унищожат злодеите и те няма да могат да постигнат целта си - унищожаване в командата на имунната система.