В играта Atom War ще отидете в света, където живеят най-малките частици, които ние наричаме атоми. В този свят е започнала война и вие ще участвате в нея. Ще видите своя червен атом на екрана пред вас. Той ще има определен размер и около него ще се вижда малко силово поле. Около вашия атом други частици ще започнат да се появяват със син цвят. Ще трябва внимателно да ги разгледате и да намерите тези, които са по-малки от вашия герой по размер. Това означава, че тези частици са по-слаби от вашия атом. Ще трябва да ги преследвате и след това да атакувате. Унищожавайки синия атом, вие ще получите точки и вашият герой ще стане по-голям и по-силен.
