Дълбоко в джунглата живее горила на име Донки, която винаги помага на приятелите си. Веднъж нашият герой реши да отиде да посети своите далечни роднини, които живеят от другата страна на джунглата. Вие в играта Super Donkey Kong 99 ще трябва да помогнете на героя в това приключение. Вашият герой ще се вижда на екрана пред вас, който под ваше ръководство ще се движи напред по пътя, като постепенно набира скорост. По пътя вашият герой ще трябва да събира банани и златни монети, разпръснати навсякъде. Той също така ще трябва да преодолее различни капани и препятствия, които ще се сблъскат по пътя му.
