Жителите на малко японско село са постоянно потискани от местния аристократ. Самурай, пътуващ през Япония, решил да им помогне. За да направи това, той ще трябва да проникне в имението на аристократ и да го унищожи. Вие в играта Mini Samurai Kurofune ще помогнете на самурая в това приключение. Вашият герой ще трябва да влезе в имението, което се охранява от наемници нинджи. Те ще атакуват вашия герой. Вие контролирате действията на героя и ще се биете срещу тях. Умело владеейки меч и използвайки техники за ръкопашен бой, ще трябва да унищожите всичките си опоненти. За това в играта Mini Samurai Kurofuna ще ви бъдат дадени точки. След смъртта на врага, събирайте трофеи, които ще паднат от него.
