Появата на супер сили не означава, че човек автоматично става супер герой. Все още не е известно как може да използва силите си; напълно възможно е да премине на тъмната страна и тогава да стане злодей. Повечето супергерои са придобили способностите си чрез някакъв вид експериментиране или външно влияние. Героинята на играта Superhero Girl Escape беше неизлечимо болна и се съгласи на експеримент, в резултат на което придоби невероятни способности и се възстанови. Военното ведомство се заинтересува от нея и момичето е взето за заложник без възможност да се освободи. Трябва да й помогнете да избяга в Superhero Girl Escape.