Сериозна опасност е надвиснала над града; скоро той ще бъде нападнат от огромно, страшно чудовище, а супергероят, който е призван да пази безопасността на жителите на града, се оказва напълно безсилен в Energy Superman 3D. Неговата суперспособност са енергийни топки, които той хвърля по врага и по този начин може да го унищожи. Но периодично героят изисква презареждане, особено ако е трябвало да използва енергията си предния ден. В играта Energy Superman 3D това е точно ситуацията и героят, преди да срещне врага, трябва да натрупа енергия и в това ще помогнете на героя на финалната линия, щракнете върху скалата, така че супер героят да атакува врага и го побеждава в Energy Superman 3D.