Изглежда, че царството на гъбите не е толкова голямо и въпреки това в него се е натрупало толкова много боклук, че вече не се побира на специално определено сметище. Кралят реши да хвърли всичко в морето, но Марио е напълно против. В Super Mario Transporter той възнамерява лично да премахне всички отпадъци далеч от родното си място, където те ще бъдат унищожени или рециклирани. За това героят подготви няколко вида товарни танкери и други кораби. Но някой трябва да помогне на героя да отвори дренажните клапани. Отпадъците не могат да бъдат объркани, те са с различни цветове и трябва да съответстват на цвета на контейнера. Къде ще ги излееш. Отворете капаците и не смесвайте течности в Super Mario Transporter.