Драконите, като всяко летящо същество, не са родени с всички необходими умения за летене. Те трябва да учат и като правило родителите или някой от старейшините дават пример. Но нашият герой дракон в играта Flappy Dragon нямаше късмет. Изгубили го много преди раждането, яйцето паднало от гнездото и бебето се родило, без да знае кои са майка му и баща му. Въпреки тежките условия той успява да оцелее и тъй като героят беше много способен, гледайки птиците, той започна да опитва крилете си. Когато успя да се издигне във въздуха, драконът реши да намери родителите си и вие можете да му помогнете да преодолее дълъг път, прелитайки около препятствия.