Марио, водопроводчик, обичан от всички нас, се интересува от такъв уличен спорт като паркур. Нашият герой реши да се тренира в този спорт на покривите на градските сгради. Вие в Super Mario City Run ще се присъедините към него в тази тренировка. Пред вас на екрана ще видите Марио да стои на покрива на къщата. Под вашето ръководство той ще тича напред, като постепенно набира скорост. Погледнете внимателно екрана. По пътя на вашия герой ще има неуспехи, разделящи покривите на сградите. Когато дотича до един от тях на определено разстояние, ще трябва да го накарате да скочи. Така вашият герой ще прескочи тази опасност. Също така пред Марио ще се появят препятствия. На някои от тях той ще може да се катери на бягане, под други, напротив, ще трябва да кара по гръб под дъното. По пътя Марио трябва да вземе различни предмети, които ще ви донесат точки и могат да дадат на героя различни видове бонуси.