За сложни и отговорни задачи, когато е невъзможно създаването на излишен шум, се назначават агенти със специални умения и способности. Такъв в играта Stealth Master 3D е нашият герой. Опитва се да не използва малки оръжия, а се справя със саби, ножове, мечове, за да действа тихо, без да привлича вниманието. Преди всяко ниво ще получите задача и трябва да я изпълните, за да получите нова. Агент от такова ниво не бива да бърка. Промъкнете се в стаята, приближете се до неподозиращ враг и нанесете удар. Ако се обърне и вашият герой е в зоната на червения лъч, мисията ще се провали в Stealth Master 3D.