Червените и сините точки искат да се срещнат, но нямат ръце или крака, които да им позволят да се движат, но точките са кръгли, което означава, че могат да се търкалят. Трябва да използвате магически молив и вашата изобретателност. За да накарате точките да се приближат една до друга, начертайте линия или форма, по която топките да се търкалят надолу и да се сблъскват една с друга. Преминете през нивата, първите шест са вече налични и можете да изберете всяко едно, без да следвате реда, трябва да преминете през всичко, за да получите достъп до останалите нива в Brain Dots.