Играта Alien Quarantine се развива на територията на тайна лаборатория, където се провеждат експерименти върху заловени извънземни същества. Един от извънземните успява да се освободи, освобождава останалите и в лабораторията започва истински хаос. Героят на играта Alien Quarantine е изпратен на разузнаване, но е изправен пред опасен враг. Той трябва да възстанови системата за сигурност, за да предотврати проникването на чудовища в други сектори. За да направите това, трябва да активирате няколко устройства, движещи се и стрелящи, избягвайки извънземни атаки.
